Hatramin'izao dia tsy niatrika afa-tsy holatra ratsy, sifotra ary minion hafa an'ny fahavalony mandrakizay i Bowser. Fa voninkazo fotsiny ireo raha ampitahaina amin'ny miandry azy ao amin'ny Super Mario Commander. Fanafihana tampoka avy eny amin'ny habakabaka no natao tampoka tamin'ny tontolon'ny Mario. Ny zava-manan'aina matahotra sy masiaka, mitam-nify, dia nanimba ny fanjakana izay nilamina taloha. Tsy maintsy mandray fitaovam-piadiana matotra i Mario ary hilalao ny maherifo maherifo. Ary mba hahombiazany dia ampio ny tompon'ny plumber hanana andraikitra vaovao ho an'ny tenany. Ilaina ny manafoana ny lampihazon'ny piraty amin'ny habakabaka ary hamerina an'izao tontolo izao indray eto amin'ny Super Mario Commander.